学院现有一个国家重点实验室（集成光电子学国家重点实验室吉林大学实验区）、一个国家级国际合作平台（微纳信息材料与器件学科创新引智基地）、十个省级科研平台（吉林省有机白光照明工程实验室、吉林省现代检测技术工程研究中心、吉林省光通信用聚合物波导器件工程实验室、吉林省先进气体传感器重点实验室、吉林省红外气体传感技术工程研究中心、物质科学吉林省高校高端科技创新平台、吉林省环境传感器与系统工程实验室、吉林省宽禁带半导体材料与器件工程实验室、吉林省固态激光雷达探测系统工程实验室、吉林省超快激光微纳制造重点实验室）、一个省级国际合作平台（微纳传感技术国际联合研究中心）、六个教学系（微电子科学与工程系、光电科学与工程系、传感科学与工程系、电子信息科学与技术系、电子信息工程系、生物医学工程系）、两个实验教学中心（电工电子实验教学中心、微电子与光电子实验教学中心）。